Диагностика токсигенных грибов – возбудителей фузариоза зерна
«Здоровье растений обеспечит АгроДиагностика»
Статья из журнала "Актуальные Агросистемы", №5, май 2018 г.
При выращивании сельскохозяйственных культур чрезвычайно важно своевременно обнаружить и идентифицировать заболевания, которые могут нанести существенный вред урожаю или погубить его полностью. О том, с помощью каких современных диагностических методов выявляются бактериальные и вирусные патогены, несущие угрозу растениям, корреспонденту ААС рассказал директор по науке компании "АгроДиагностика", доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАН Сергей Кириакович Завриев.
Скачать статью полностью в PDF (1,3 Мегабайта)
Грибы рода Fusarium являются опасными патогенами, распространёнными по всему миру и наносящими существенный ущерб сельскохозяйственному производству. Помимо потерь, непосредственно связанных со снижением количества и качества урожая, заражение растений возбудителями фузариоза приводит к накоплению в зерне и растительном материале микотоксинов — вторичных метаболитов грибов, представляющих большую угрозу для здоровья и жизни человека и сельскохозяйственных животных. Всего различные представители рода Fusarium синтезируют более 100 токсических соединений, основными группами которых являются трихотецены, фумонизины, зеараленон, энниатины. По данным ФАО — продовольственной и сельскохозяйственной организации ООН, 25% производимого в мире урожая зерновых культур загрязнено микотоксинами. Примером опасности, которую представляют фузариотоксины, может служить вспышка алиментарно-токсической алейкии (АТА), вызвавшая гибель тысяч людей на Урале и в Поволжье в 40-х годах ХХ в. Причиной эпидемии стало потребление в пищу зерна, зараженного возбудителями фузариоза. На сегодняшний день подтверждением важности изучения и разработки методов борьбы с токсигенными возбудителями фузариоза злаковых являются принятые Европейским cсоюзом правила, регулирующие методы отбора проб и анализов для обязательного контроля микотоксинов в продуктах питания и кормах (Commission regulation (EC) № 856/2005 of 6-th June 2005). Поскольку продуцирование микотоксинов носит ярко выраженный видоспецифичный характер, для оценки спектра соединений, накопление которых возможно в анализируемой партии зерна, требуется точная информация о видовом составе присутствующих в ней патогенов. Кроме того, в процессе хранения зерна токсины могут отсутствовать или иметься в концентрациях, ниже предельно допустимых, однако их активный синтез может начаться под воздействием биотических и абиотических стрессов, таких, например, как изменения условий хранения, связанные с колебаниями температуры и влажности. Таким образом, критичным является выявление в пробе не только непосредственно токсинов, но и их продуцентов.
Наиболее эффективным методом обнаружения и идентификации токсигенных грибов в зерне, продуктах его переработки, а также растительном материале на сегодняшний день является метод ПЦР, позволяющий получить результат быстро, с высокой чувствительностью и специфичностью. ООО «АгроДиагностика» предлагает наборы для диагностики широкого спектра возбудителей фузариоза зерна в двух вариантах: видоспецифичное определение основных возбудителей фузариоза, а также детекция групп близкородственных видов, характеризующихся сходными спектрами продуцируемых микотоксинов. Оба варианта доступны в форматах электрофореза и ПЦР «в реальном времени».
Представляется актуальным проведение предлагаемых анализов для контроля зерна и продуктов его переработки, соответствующих продуктов питания и кормов. Особенно важно осуществлять контроль и мониторинг партий зерна, которые закладываются на хранение или транспортируются на большие расстояния.
Хотелось бы отметить, что разработанные в ООО «АгроДиагностика» системы позволили уточнить видовую принадлежность целого ряда грибов рода Fusarium из всероссийских коллекций.
Также в ООО «АгроДиагностика» доступны наборы для выявления возбудителей септориоза Septoria tritici и Stagonospora nodorum.
Наши публикации:
1. ДИАГНОСТИКА ТОКСИГЕННЫХ ГРИБОВ РОДА FUSARIUM МЕТОДОМ FLASH-PCR
Рязанцев Д. Ю., Абрамова С. Л., Евстратова С. В., Гагкаева Т. Ю., Завриев С. К.
Биоорганическая химия. 2008. Т. 34. № 6. С. 799-807.
2. PCR DETECTION OF FUSARIUM FUNGI WITH SIMILAR PROFILES OF THE PRODUCED MYCOTOXINS
Stakheev A. A., Ryazantsev D. Y., Zavriev S. K., Gagkaeva T. Y.
Food Control. 2011. Т. 22. № 3-4. С. 462-468.
3. ПЕРВОЕ ОБНАРУЖЕНИЕ В РОССИИ ГРИБА FUSARIUM TORULOSUM
Гагкаева Т. Ю., Гаврилова О. П., Стахеев А. А., Рязанцев Д. Ю., Завриев С. К.
Микология и фитопатология. 2012. Т. 46. № 1. С. 86-91.
4. ГЕН ФОСФАТПЕРМЕАЗЫ КАК МАРКЕР ДЛЯ ВИДОСПЕЦИФИЧЕСКОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ТОКСИГЕННОГО ГРИБА FUSARIUM CEREALIS
Стахеев А. А., Хайрулина Д. Р., Рязанцев Д. Ю., Завриев С. К.
Биоорганическая химия. 2013. Т. 39. № 2. С. 175.
5. ФУЗАРИОЗ И ДИАГНОСТИКА ЗАРАЖЁННОСТИ КОНЦЕНТРИРОВАННЫХ КОРМОВ ЕГО ОСНОВНЫМИ ВОЗБУДИТЕЛЯМИ
Стахеев А. А., Некрасов Р. В., Гладырь Е. А., Завриев С. К.
Кормопроизводство. 2014. № 7. С. 42-48.
6. ДИАГНОСТИКА ФИТОПАТОГЕННЫХ ГРИБОВ SEPTORIA TRITICI И STAGONOSPORA NODORUMМЕТОДОМ FLASH-ПЦР
Абрамова С. Л., Рязанцев Д. Ю., Воинова Т. М., Завриев С. К.
Биоорганическая химия. 2008. Т. 34. № 1. С. 107-113.
7. А.А. Стахеев, Ю.К. Звездина, О.Д. Микитюк, С.К. Завриев.
Изучение токсинообразования и полиморфизма трихотеценовых генов у грибов рода Fusarium российских коллекций. Материалы юбилейной конференции по микологии и микробиологии. Москва, 11-12 апреля 2018. Успехи медицинской микологии, том XIX, стр. 337-343.
https://elibrary.ru/item.asp?id=35094155
8. А.А. Стахеев, Д.Ю. Рязанцев, Л.В. Самохвалова,С.К. Завриев.
Выявление токсигенных возбудителей фузариоза в зерне и концентрированных кормах с помощью диагностических систем на основе количественной ПЦР. Сборник трудов IX всероссийской научно-практической конференции с международным участием "Молекулярная диагностика 2017". Том 2, стр. 428-429., Москва, 18-20 апреля 2017 г.
https://elibrary.ru/item.asp?id=30357158
9. A.A. Stakheev, Khairulina D.R., Zavriev S.K. (2016).
ВFour-locus phylogeny of Fusarium avenaceum and related species and their species-specific identification based on partial phosphate permease gene sequences. International Journal of Food Microbiology. 225, 27-37.
https://elibrary.ru/item.asp?id=27067878
Подходящие наборы для ПЦР
| Наименование | Форматы | ||
| FLASH | Rt | ||
| Комплекты реагентов для диагностики болезней картофеля | |||
| Кольцевая гниль картофеля (Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus) |  |
|
|
| Бурая бактериальная гниль (Ralstonia solanacearum) | |
|
|
| Вирус скручивания листьев картофеля (Potato Leafroll Virus) | |
|
|
| M вирус картофеля (Potato Virus M) | |
|
|
| S вирус картофеля (Potato Virus S) | |
|
|
| Х вирус картофеля (Potato Virus X) | |
|
|
| Вироид веретеновидности клубней картофеля (Potato Spindle Tuber Viroid) | |
|
|
| Y вирус картофеля (Potato Virus Y) | |
|
|
| A вирус картофеля (Potato Virus A) | |
|
|
| Вирус метельчатости клубней картофеля (Potato Mop Top virus) | |
|
|
| Андийский вирус крапчатости картофеля (Andean potato mottle virus) | |
||
| Андийский латентный вирус картофеля (Andean potato latent virus) | |
||
| Бледная картофельная цистообразующая нематода (Globodera pallida) | |
|
|
| Золотистая картофельная цистообразующая нематода (Globodera rostochiensis) | |
|
|
| Рак картофеля (Synchytrium endobioticum) | |
||
| Вирус черной кольцевой пятнистости картофеля (Potato black ringspot virus) | |
||
| T вирус картофеля (Potato virus T) | |
||
| Вирус пожелтения картофеля (Potato yellowing virus) | |
||
| Вирус жёлтой карликовости картофеля (Potato yellow dwarf virus) | |
||
| Комплект реагентов для амплификации кДНК гена актина картофеля | |
|
|
| Комплекты реагентов для диагностики болезней сахарной свеклы | |||
| Ризомания сахарной свеклы (вирус некротического пожелтения жилок сахарной свеклы, beet necrotic yellow vein virus) | |
||
| Гниль сахарной свёклы (Pseudomonas syringae) | |
||
| Комплекты реагентов для диагностики болезней огурцов и томатов, выращиваемых в закрытом грунте | |||
| Черная бактериальная пятнистость томатов (Xanthomonas euvesicatoria, ранее Xanthomonas campestris pv. vesicatoria тип А) | |
|
|
| Некроз сердцевины стебля томата (Pseudomonas corrugata) | |
|
|
| Угловатая пятнистость листьев(Pseudomonas syringae pv. Lacrimans, ранее Pseudomonas lacrimans) | |
|
|
| Бактериальный рак томатов (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) | |
||
| Водянистая гниль плодов (Pectobacterium carotovorum subsp. сarotovorum, син. Erwinia carotovora subsp. carotovora) | |
||
| Аскохитоз огурца (Ascochyta cucumis; Phoma cucurbitacearum; Didymella bryoniae) Аскохитоз томата (Ascochyta lycopersici, син. Didymella lycopersici) Грибы рода Ascochyta (Didymella, Phoma) | |
||
| Вирус кольцевой пятнистости томата (Tomato ringspot virus) | |
||
| Вирус желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl begomovirus) | |
||
| Вирус бронзовости томата (Tomato spotted wilt virus) | |
||
| Вирус коричневой морщинистости плодов томата (Tomato brown rugose fruit virus) | |
||
| Комплекты реагентов для диагностики болезней злаковых Септориозы |
|||
| Септориоз пшеницы (Septoria nodorum) | |
||
| Септориоз пшеницы (Septoria tritici) | |
||
| Комплекты реагентов для диагностики болезней злаковых Фузариозы |
|||
| Fusarium graminearum | |
||
| Fusarium culmorum | |
||
| Fusarium sporotrichioides | |
||
| Fusarium langsethiae | |
||
| Fusarium poae | |
||
| Fusarium avenaceum | |
||
| Fusarium tricinctum | |
||
| Fusarium cerealis | |
||
| Fusarium acuminatum* | |
||
| Fusarium torulosum* | |
||
| Fusarium solani* | |
||
| Комплекты реагентов для идентификации токсинпродуцирующих грибов — возбудителей фузариозов злаковых по спектру продуцируемых ими токсинов | |||
| Токсины DON,
Продуценты: Fusarium graminearum, Fusarium culmorum, Fusarium cerealis |
|
||
| Токсины T-2, HT-2, DAS, NEO, ZEA Продуценты: Fusarium sporotrichiodes, Fusarium langsethiae |
|
||
| Токсины NIV, FUSX, T-2, HT-2, DAS, ZEA Продуценты: Fusarium poae |
|
||
| Токсины MON, BEA, ENN A, B Продуценты: Fusarium avenaceum, Fusarium tricinctum, Fusarium acuminatum, Fusarium torulosum |
|
||
| Комплекты реагентов для диагностики болезней и вредителей плодовых культур | |||
| Вирус шарки сливы (Plum Pox virus) | |
|
|
| Бактериальный ожог плодовых (Erwinia amilovora) | |
|
|
| Средиземноморская плодовая муха (Ceratitis capitata) | |
||
| Вирус кольцевой пятнистости малины (Raspberry ringspot virus) | |
||
| Фитоплазма золотистого пожелтения винограда (Candidatus Phytoplasma Vitis) | |
||
| Фитоплазма истощения груши (Candidatus Phytoplasma pyri) | |
||
| Фитоплазма пролиферации яблони (Candidatus Phytoplasma mali) | |
||
| Вироид латентной мозаики персика (Peach latent mosaic viroid) | |
||
| Вирус розеточной мозаики персика (Peach rosette mosaic virus) | |
||
| Комплекты реагентов для диагностики карантинных патогенов | |||
| Нью-Дели вирус курчавости листьев томата (Tomato leaf curl New Delhi virus, ToLCNDV) Новинка! | |
|
|
| Вирус мозаики пепино (Pepino mosaic virus) Новинка! | |
|
|
| Кольцевая гниль картофеля (Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus) | |
|
|
| Бактериальный ожог плодовых (Erwinia amilovora) | |
|
|
| Бурая бактериальная гниль (Ralstonia solanacearum) | |
|
|
| Вирус шарки сливы (Plum Pox virus) | |
|
|
| Бледная картофельная цистообразующая нематода (Globodera pallida) | |
|
|
| Золотистая картофельная цистообразующая нематода (Globodera rostochiensis) | |
|
|
| Сосновая древесная нематода (Bursaphelenchus xylophilus) | |
|
|
| Сосновая древесная нематода (Bursaphelenchus mucronatus) | |
|
|
| Бактериальный вилт кукурузы (Pantoea stewartii) | |
|
|
| Средиземноморская плодовая муха (Ceratitis capitata) | |
||
| Ризомания сахарной свеклы (вирус некротического пожелтения жилок сахарной свеклы, beet necrotic yellow vein virus) | |
|
|
| Андийский вирус крапчатости картофеля (Andean potato mottle virus) | |
||
| Андийский латентный вирус картофеля (Andean potato latent virus) | |
||
| Фомопсис подсолнечника Diaporthe helianthi (Phomopsis helianthi) | |
|
|
| Рак картофеля (Synchytrium endobioticum) | |
||
| Вирус черной кольцевой пятнистости картофеля (Potato black ringspot virus) | |
||
| Вирус кольцевой пятнистости малины (Raspberry ringspot virus) | |
||
| Вирус кольцевой пятнистости табака (Tobacco ringspot virus) | |
||
| Вирус кольцевой пятнистости томата (Tomato ringspot virus) | |
||
| Фитоплазма золотистого пожелтения винограда (Candidatus Phytoplasma Vitis) | |
||
| Фитоплазма истощения груши (Candidatus Phytoplasma pyri) | |
||
| Фитоплазма пролиферации яблони (Candidatus Phytoplasma mali) | |
||
| Вироид латентной мозаики персика (Peach latent mosaic viroid) | |
||
| Вирус желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl begomovirus) | |
||
| Вирус бронзовости томата (Tomato spotted wilt virus) | |
||
| Бактериальная пятнистость тыквенных культур (Acidovorax citrulli) | |
||
| Вирус некротической пятнистости бальзамина (Impatiens necrotic spot tospovirus) | |
||
| T вирус картофеля (Potato virus T) | |
||
| Вирус пожелтения картофеля (Potato yellowing virus) | |
||
| Вирус некроза стеблей хризантем (Chrysanthemum stem necrosis virus) | |
||
| Вироид задержки роста хризантем (Chrysanthemum stunt viroid) | |
||
| Вирус жёлтой карликовости картофеля (Potato yellow dwarf virus) | |
||
| Бактериальный ожог риса (Xanthomonas oryzae pv. Oryzae) | |
||
| Сосудистый бактериоз капусты (Xanthomonas campestris pv. Campestris) | |
||
| Вирус розеточной мозаики персика (Peach rosette mosaic virus) | |
||
| Вирус коричневой морщинистости плодов томата (Tomato brown rugose fruit virus) | |
||
| Вирус штриховатой мозаики ячменя (Barley stripe mosaic virus, BSMV) | |
||
| Вирус полосатой мозаики пшеницы (Wheat streak mosaic virus, WSMV) | |
||
| Вирус мозаики костра (Brome mosaic virus, BMV) | |
||
| Вирус мозаичной карликовости кукурузы (Maize dwarf mosaic virus, MDMV) | |
||
| Комплекты реагентов для выделения нуклеиновых кислот | |||
| Комплект реагентов для выделения РНК из растительной ткани «Проба-НК» | |||
| Комплект реагентов для выделения ДНК «Проба-ГС» | |||
| Комплект реагентов для выделения ДНК «Проба – ЦТАБ» | |||
| Комплект реагентов для проведения обратной транскрипции | |||
| Комплекты реагентов для проведения ПЦР | |||
| Базовые комплекты реагентов для проведения ПЦР (в ассортименте) | |
|
|
* - данные наборы производятся только по предварительному заказу
